公的迷你鹦鹉鱼嘴巴比较粗大,母的则细长。雄性迷你鹦鹉鱼的腹部为白色,雌性则是黄色。公的体型会比较宽厚一些,而且背鳍和臀鳍上都有刺,母的身材则娇小许多。如果想要区分它们两个很简单,雄性的尾柄上方有块黑斑,雌性没有;雄性的背鳍、臀鳍以及胸鳍上面都带有黑色条纹,并且身上还带有金属光泽,但雌性就不具备这样的特征了。雄性迷你鹦鹉鱼体型比较修长,头顶有着明显突出的头瘤,并且头瘤上面也布满了红色的斑点,看起来非常漂亮。母的体型短胖圆润,身上没有明显的突出物,头瘤相对于雄性的来说要更加平滑一些。